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X光胸片可粗略检查心脏、主动脉、肺、胸膜、肋骨等，可以检查有无肺纹理增多、肺部钙化点、主动脉结钙化等。 胸部CT检查显示出的结构更清晰，对胸部病变检出敏感性和显示病变的准确性均优于常规X光胸片，特别是对于早期肺癌确诊有决定性意义。但是CT检查的辐射剂量高于X光。核磁对于肺部疾病的诊断，应用非常有限。 颈椎病、腰椎间盘突出等椎间盘疾病则需要观察椎间盘与相应的神经根，要想更好观察这些软组织，最优选择就是核磁。同样，对于关节、肌肉、脂肪组织检查，核磁也是首选。
腹腔器官受呼吸影响较大，进而影响到CT、核磁成像，而超声不会因此受影响。同时，超声对肝脏、脾脏、胰腺、肾脏、盆腔脏器等诊断准确率较高。
常规的心脏结构与功能检查，心脏彩超所提供的信息已经较为充分，又简单易行。 用CT可检查冠状动脉，但冠脉CT检查辐射量较大，不适合作为常规体检。核磁虽无电磁辐射，但对冠状动脉的观察不及CT。心脏核磁则是评价心脏结构和功能的“金标准”。
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